Como una de las artistas latinas más influyentes de todos los tiempos, Cruz fue honrada a lo largo de su vida y en la posteridad con numerosos premios, exposiciones, sellos conmemorativos, muestras de artistas importantes y homenajes, incluyendo una Medalla Nacional de las Artes, un Premio Smithsonian a la Trayectoria, una estrella en el Paseo de la Fama de Hollywood, diez nominaciones a los premios GRAMMY y un Premio GRAMMY® póstumo a la Trayectoria. Cruz también fue incluida en la Billboard Salón de la Fama de la Música Latina y el Salón Internacional de la Fama de la Música Latina, entre otros, mientras que en 2024, se convirtió en la primera afrolatina en aparecer en la moneda estadounidense a través del Programa American Women's Quarter.